MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013205	GC	3	6	148113	148118	0 %	0 %	50 %	50 %	258510151
3002	NC_013205	GCC	2	6	148169	148174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510151
3003	NC_013205	ATTTTC	2	12	148210	148221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	258510151
3004	NC_013205	CGA	2	6	148224	148229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510151
3005	NC_013205	CAA	2	6	148233	148238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510151
3006	NC_013205	AGGGCA	2	12	148298	148309	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258510151
3007	NC_013205	TCA	2	6	148325	148330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510151
3008	NC_013205	AGG	2	6	148337	148342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510151
3009	NC_013205	TTC	2	6	148387	148392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510151
3010	NC_013205	GA	3	6	148431	148436	50 %	0 %	50 %	0 %	258510151
3011	NC_013205	TTG	2	6	148442	148447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510151
3012	NC_013205	TCG	2	6	148559	148564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510151
3013	NC_013205	CCT	2	6	148575	148580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510151
3014	NC_013205	CGTG	2	8	148608	148615	0 %	25 %	50 %	25 %	258510151
3015	NC_013205	GCG	2	6	148624	148629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510151
3016	NC_013205	CGAC	2	8	148679	148686	25 %	0 %	25 %	50 %	258510151
3017	NC_013205	GC	3	6	148765	148770	0 %	0 %	50 %	50 %	258510151
3018	NC_013205	TGA	2	6	148790	148795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510151
3019	NC_013205	GTA	2	6	149044	149049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
3020	NC_013205	GC	3	6	149078	149083	0 %	0 %	50 %	50 %	258510152
3021	NC_013205	CAC	2	6	149230	149235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510152
3022	NC_013205	CCG	2	6	149266	149271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510152
3023	NC_013205	GAC	2	6	149275	149280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3024	NC_013205	TGA	2	6	149304	149309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
3025	NC_013205	ACA	2	6	149316	149321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510152
3026	NC_013205	TCG	2	6	149351	149356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3027	NC_013205	GTA	2	6	149428	149433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
3028	NC_013205	CCA	3	9	149457	149465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510152
3029	NC_013205	TGT	2	6	149466	149471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510152
3030	NC_013205	AGA	2	6	149550	149555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510152
3031	NC_013205	GCCA	2	8	149602	149609	25 %	0 %	25 %	50 %	258510152
3032	NC_013205	TCG	2	6	149612	149617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3033	NC_013205	TG	3	6	149638	149643	0 %	50 %	50 %	0 %	258510152
3034	NC_013205	CTT	2	6	149649	149654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510152
3035	NC_013205	CGT	2	6	149665	149670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3036	NC_013205	TCC	3	9	149681	149689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510152
3037	NC_013205	CG	3	6	149700	149705	0 %	0 %	50 %	50 %	258510152
3038	NC_013205	ATG	2	6	149714	149719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
3039	NC_013205	ACAA	2	8	149759	149766	75 %	0 %	0 %	25 %	258510152
3040	NC_013205	CTT	2	6	149869	149874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510152
3041	NC_013205	GTC	2	6	149930	149935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3042	NC_013205	GCA	2	6	150084	150089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510153
3043	NC_013205	GCG	3	9	150214	150222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510153
3044	NC_013205	C	6	6	150267	150272	0 %	0 %	0 %	100 %	258510153
3045	NC_013205	CGC	2	6	150315	150320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510153
3046	NC_013205	CGG	2	6	150335	150340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510153
3047	NC_013205	G	6	6	150360	150365	0 %	0 %	100 %	0 %	258510153
3048	NC_013205	CG	3	6	150379	150384	0 %	0 %	50 %	50 %	258510153
3049	NC_013205	CCG	2	6	150437	150442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510153
3050	NC_013205	GCC	3	9	150464	150472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510153
3051	NC_013205	CGT	2	6	150474	150479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510153
3052	NC_013205	CCG	2	6	150751	150756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510153
3053	NC_013205	AGA	2	6	150847	150852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510153
3054	NC_013205	ACGAAG	2	12	151107	151118	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258510154
3055	NC_013205	GC	4	8	151265	151272	0 %	0 %	50 %	50 %	258510154
3056	NC_013205	GAG	2	6	151337	151342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
3057	NC_013205	GC	3	6	151417	151422	0 %	0 %	50 %	50 %	258510154
3058	NC_013205	GGA	2	6	151500	151505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
3059	NC_013205	GCC	2	6	151544	151549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510154
3060	NC_013205	AGG	2	6	151566	151571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
3061	NC_013205	TCGG	2	8	151607	151614	0 %	25 %	50 %	25 %	258510154
3062	NC_013205	CAA	2	6	151633	151638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510154
3063	NC_013205	GGA	2	6	151645	151650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
3064	NC_013205	GCC	2	6	151654	151659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510154
3065	NC_013205	CCCA	2	8	151673	151680	25 %	0 %	0 %	75 %	258510154
3066	NC_013205	GCG	2	6	151689	151694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510154
3067	NC_013205	CGC	2	6	151724	151729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510154
3068	NC_013205	CGC	2	6	151752	151757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510154
3069	NC_013205	AGG	2	6	151762	151767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
3070	NC_013205	CG	3	6	151888	151893	0 %	0 %	50 %	50 %	258510154
3071	NC_013205	GGC	2	6	151911	151916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510154
3072	NC_013205	CTG	2	6	151988	151993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510154
3073	NC_013205	GTC	2	6	151997	152002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510154
3074	NC_013205	CGGCG	2	10	152029	152038	0 %	0 %	60 %	40 %	258510154
3075	NC_013205	TCA	2	6	152055	152060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510154
3076	NC_013205	GCA	2	6	152106	152111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510154
3077	NC_013205	GGT	2	6	152116	152121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510154
3078	NC_013205	TC	3	6	152135	152140	0 %	50 %	0 %	50 %	258510154
3079	NC_013205	TTG	2	6	152187	152192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510154
3080	NC_013205	GTGGC	2	10	152207	152216	0 %	20 %	60 %	20 %	258510154
3081	NC_013205	GAA	2	6	152230	152235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510154
3082	NC_013205	CTTCCG	2	12	152280	152291	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258510154
3083	NC_013205	GTGGC	2	10	152418	152427	0 %	20 %	60 %	20 %	258510155
3084	NC_013205	TGA	2	6	152454	152459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510155
3085	NC_013205	GTG	2	6	152465	152470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510155
3086	NC_013205	CAG	3	9	152564	152572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510155
3087	NC_013205	TGA	2	6	152589	152594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510155
3088	NC_013205	AC	3	6	152634	152639	50 %	0 %	0 %	50 %	258510155
3089	NC_013205	CCGGTA	2	12	152670	152681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510155
3090	NC_013205	CGG	2	6	152728	152733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510155
3091	NC_013205	CAGC	2	8	152791	152798	25 %	0 %	25 %	50 %	258510155
3092	NC_013205	TTC	2	6	152896	152901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510155
3093	NC_013205	CTC	2	6	152905	152910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510155
3094	NC_013205	GGC	2	6	153074	153079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510156
3095	NC_013205	CGG	2	6	153088	153093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510156
3096	NC_013205	CG	3	6	153138	153143	0 %	0 %	50 %	50 %	258510156
3097	NC_013205	CTT	2	6	153150	153155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510156
3098	NC_013205	ATC	2	6	153192	153197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510156
3099	NC_013205	CATC	2	8	153250	153257	25 %	25 %	0 %	50 %	258510156
3100	NC_013205	CGG	2	6	153280	153285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510156
3101	NC_013205	AACGG	2	10	153312	153321	40 %	0 %	40 %	20 %	258510156
3102	NC_013205	CGG	2	6	153325	153330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510156
3103	NC_013205	GAC	2	6	153372	153377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510156
3104	NC_013205	TGAGC	2	10	153541	153550	20 %	20 %	40 %	20 %	258510156
3105	NC_013205	CCA	2	6	153683	153688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510157
3106	NC_013205	CGG	2	6	153713	153718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510157
3107	NC_013205	G	6	6	153744	153749	0 %	0 %	100 %	0 %	258510157
3108	NC_013205	TGACC	2	10	153953	153962	20 %	20 %	20 %	40 %	258510157
3109	NC_013205	GTC	2	6	154260	154265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510158
3110	NC_013205	CGC	2	6	154269	154274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510158
3111	NC_013205	CCG	2	6	154277	154282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510158
3112	NC_013205	A	7	7	154301	154307	100 %	0 %	0 %	0 %	258510158
3113	NC_013205	TCT	2	6	154435	154440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510158
3114	NC_013205	GAG	2	6	154469	154474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510158
3115	NC_013205	CG	3	6	154484	154489	0 %	0 %	50 %	50 %	258510158
3116	NC_013205	GC	3	6	154507	154512	0 %	0 %	50 %	50 %	258510158
3117	NC_013205	TGGTCG	2	12	154542	154553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258510158
3118	NC_013205	GAA	2	6	154562	154567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510158
3119	NC_013205	TGA	2	6	154569	154574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510158
3120	NC_013205	TGGCG	2	10	154581	154590	0 %	20 %	60 %	20 %	258510158
3121	NC_013205	TCGT	2	8	154616	154623	0 %	50 %	25 %	25 %	258510158
3122	NC_013205	CGCA	2	8	154703	154710	25 %	0 %	25 %	50 %	258510158
3123	NC_013205	TG	3	6	154716	154721	0 %	50 %	50 %	0 %	258510158
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3231	NC_013205	TCG	2	6	159684	159689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510162
3232	NC_013205	GGCG	2	8	159694	159701	0 %	0 %	75 %	25 %	258510162
3233	NC_013205	CG	3	6	159730	159735	0 %	0 %	50 %	50 %	258510162
3234	NC_013205	TGA	2	6	159763	159768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510162
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3236	NC_013205	TCG	2	6	160035	160040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510162
3237	NC_013205	GGCGT	2	10	160064	160073	0 %	20 %	60 %	20 %	258510162
3238	NC_013205	G	6	6	160129	160134	0 %	0 %	100 %	0 %	258510162
3239	NC_013205	CGG	2	6	160164	160169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510162
3240	NC_013205	GGA	2	6	160180	160185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510162
3241	NC_013205	GCT	2	6	160207	160212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510162
3242	NC_013205	CGC	2	6	160213	160218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510162
3243	NC_013205	GC	3	6	160360	160365	0 %	0 %	50 %	50 %	258510162
3244	NC_013205	CGGAG	2	10	160525	160534	20 %	0 %	60 %	20 %	258510162
3245	NC_013205	GC	3	6	160578	160583	0 %	0 %	50 %	50 %	258510162
3246	NC_013205	ACCA	2	8	160592	160599	50 %	0 %	0 %	50 %	258510162
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3249	NC_013205	GGC	2	6	160721	160726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510162
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3251	NC_013205	GAAG	2	8	160747	160754	50 %	0 %	50 %	0 %	258510162
3252	NC_013205	CGG	2	6	160938	160943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510163
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3283	NC_013205	CGG	2	6	162335	162340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510164
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3358	NC_013205	GTC	2	6	165600	165605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510167
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3362	NC_013205	TCG	2	6	165715	165720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510167
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3475	NC_013205	CGCA	2	8	168317	168324	25 %	0 %	25 %	50 %	258510169
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3482	NC_013205	GC	3	6	168691	168696	0 %	0 %	50 %	50 %	258510169
3483	NC_013205	TGG	2	6	168728	168733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510169
3484	NC_013205	GAT	2	6	168765	168770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510169
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3486	NC_013205	CAA	2	6	168945	168950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510169
3487	NC_013205	CCA	2	6	168962	168967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510169
3488	NC_013205	TTC	2	6	168979	168984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510169
3489	NC_013205	CGG	2	6	168987	168992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510169
3490	NC_013205	GGC	2	6	169068	169073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510169
3491	NC_013205	AAG	2	6	169120	169125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510169
3492	NC_013205	CCGC	2	8	169190	169197	0 %	0 %	25 %	75 %	258510170
3493	NC_013205	GGC	2	6	169198	169203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510170
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3495	NC_013205	GGC	2	6	169216	169221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510170
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3499	NC_013205	GAG	2	6	169561	169566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510170
3500	NC_013205	GCA	2	6	169578	169583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510170

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